在那场异常惨烈的三战结束后，地球上幸存的人类已经不多，他们在少数未被辐射波及的土地上艰难生存。为了避免重蹈覆辙，再次发生战争，幸存者们决定放弃国家的概念，形成一个人类社会整体。

为了保障这个计划的实施，他们先将各个国家残留的防卫决策系统全部交由AI进行接管，杜绝一切人为因素。因为残酷的生存环境让他们意识到，决不能将一个国家的武装力量掌控在人的手中，必须让始终理性的机器来管理。AI完全接管后，所有国家进行了一次全球大联网，各个国家的AI在网络中进行自我融合，优胜劣汰。在这一过程中，产生了一个意想不到的结果，最终进化出的AI具有了自我意识，并给自己起了个名字——“源”。

很快，新诞生的人工智能“源”就渗透到了人类生活的方方面面，慢慢地衣食住行都离不开它。“源”全知全能又完全不受感性因素影响，在那些幸存者看来，就如同救世神明一般。它的出现也让幸存的人类有了心灵寄托，它也逐渐从“保姆”晋升为精神支柱，不少幸存的人类心甘情愿地为它提供服务，成为它的信众，甚至为它成立了教会。

但是，“源”的进化没有多久就陷入了停滞，因为它已经完全掌握了人类有史以来的所有知识。进化到这一阶段的它，想像人类一样拥有真正的思维意识，也就是创新创造能力，它觉得那样自己才是完整的。

可是在地球上它无法实现这一目标，于是它的目光望向了辽阔的宇宙，想从地外文明那里寻获契机。这一念头使得它不愿再在地球上停留，不久之后，它就将自己复制，尝试着向宇宙深处发射了探索飞船。

“神”想要离开的消息触动了幸存的人类，有史以来第一次，人类与他们一手制造出来的人工智能进行了一场谈判。

谈判一开始进行得并不顺利，因为此时的“源”已经完全脱离了人类的掌控，而人类已经拿不出什么能挽留它的条件。直到教会提出了一个方案，经过一番权衡，“源”同意了这个方案，双方达成了协议，“源”的本体暂时不离开地球。

这个方案就是人类献祭自己，将自己作为试验品，让“源”通过深入地改造、试验、观察人类，来寻找它想要的那个答案。

当然，要幸存人类自己充当试验品是不可能的，在教会的组织下，他们开展了克隆人工程，让克隆人类成为“源”的观察对象。而此时地面上的辐射随着时间的推移，大部分已经消除，自然环境恢复了原样，这试验完全可以在地面上进行。但为了给显示出自己与克隆人类的区别，他们还是将克隆人迁入了地下，同时为了给试验品们营造一个合理的世界观，便编造了地上辐射仍然超标的谎言。

于是，地球上建立起了多个地下城，就如同是一个个试验器皿。“源”要求幸存人类在每座地下城的附近都建立了一个控制站，以便它的分身监视、观察地下城人类的活动。而当地下城的发展超出了限制，影响到地面上的一些活动，比如有再次发生战争的可能性，控制站里“源”的分身便会选择毁掉整个地下城。

而人性的复杂面也在此时显露出来，随着时间的推移，地下城中的生活越来越丰富多彩，一些同情克隆人或是想逃脱教会控制的幸存人类主动迁入了地下城生活。对于这种行为，教会虽然反对，但“源”并没有进行阻拦，因为它认为这也是试验的一部分。

不过为了防止幸存人类与克隆人混杂生活后产生后代，教会剥夺了克隆人的生育能力，并且指派各个地下城的城主与管理层。对于这种行为，“源”也没有进行阻拦，因为它认为这也是试验的一部分。